В период 1975-1997 гг. ЗСФ ИЛ существовал в форме Отдела леса Института леса и древесины СО АН СССР (впоследствии Института леса СО РАН).
Отдел был выделен из Биологического института СО АН и передан в Институт леса в 1975 г. Численность отдела достигала около 50 человек и вплоть до 1993 г. он включал 3 лаборатории: лесоведения, плодоношения и энтомофагов.
В 1993 г. в связи с редукцией численности до 30 чел. лабораторное деление было упразднено. Постановлением Президиума СО РАН от 01 декабря 1997 г. № 435 отдел был преобразован в филиал.
В 2010 г. в составе филиала выделены 3 группы: лесных генетических ресурсов, лесообразовательного процесса и лесной геоботаники.
В 2016 году в связи с образованием Федерального исследовательского центра «Красноярский научный центр» куда вошел и Институт леса им. В.Н. Сукачева СО РАН, филиал был преобразован в Западно-Сибирское отделение Института леса им. В.Н. Сукачева Сибирского отделения Российской академии наук – филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения "Федеральный исследовательский центр "Красноярский научный центр Сибирского отделения Российской академии наук" (ЗСО ИЛ СО РАН – филиал ФИЦ КНЦ СО РАН).
Заведующими отделом (директорами филиала) в хронологическом порядке были:
д.б.н. проф. Н.Г. Коломиец,
д.б.н. В.Н. Габеев,
д.б.н. В.Н. Седых,
к.б.н. В.И. Барановский,
д.с.-х.н. В.В. Тараканов.
Кроме перечисленных в филиале трудились такие известные сибирские ученые, как Л.А. Ламин, Э.Н. Бокк, И.А. Бех, В.Н. Воробьев, С.В. Васильев, Ю.Б. Алексеев, Д.А. Богданова, В.А. Куделя, Т.П. Некрасова, А.И. Земляной и др.
